A fin de definir su campo de acción FUNSALUD ha realizado catorce estudios sobre el estado del arte en distintos problemas de salud. Los estudios identificaron nichos de oportunidad y su factibilidad técnica, económica, social y política.

FUNSALUD apoya tanto la consolidación de la infraestructura de investigación en México, cuanto la pesquisa en problemas de salud que inciden en grupos de riesgo o que tienen peso significativo en las condiciones de salud de la población. Las investigaciones generan productos de trascendencia social y contribuyen, en cierta medida, a la superación de condiciones adversas de salud.